對于不同的混凝劑聚丙烯酰胺，水體pH值對混凝效果的影響程度也不同。鋁鹽和鐵鹽混凝劑，由于他們的水解產物直接受到水體pH值的影響，所以影響程度較大，尤其是硫酸鋁。對于聚合形態的混凝劑，如聚合氯化鋁和其它高分子混凝劑，其混凝效果受水體pH值的影響程度較小，因為它的分子結構在投入水中之前就已經形成。
對硫酸鋁而言，用于去除濁度時，最佳的pH值在6.5~7.5之間;用于去除色度時，pH值在4.5~5.5之間。對于三氯化鐵等三價鐵鹽混凝劑，適用的pH值范圍較鋁鹽混凝劑系列要寬;用于去除色度時，pH值為3.5~5.0之間。
與無機混凝劑相比，高分子絮凝劑聚丙烯酰胺受PH值影響小，但嚴格說來還是有影響的，通常，陽離子聚丙烯酰胺在偏酸性、陰離子聚丙烯酰胺在偏堿性的條件下易發揮其效果。這是由于PH值影響到高分子鏈在懸濁液中的松弛程度，從而影響到它性能的發揮。
對于被處理的水體而言，比較典型的是在含蛋白質的場合，要用酸或堿調節到等電點附近，使蛋白質處于不穩定狀態，再加絮凝劑。
